蛇口港區：

蛇口港區為深圳 市重要的水、陸客貨運輸樞紐和設備齊全、綜合性、多功能的對外開放口岸，主要經營散雜貨、客運、集裝箱、油氣品和船舶維修。該港區內主要有蛇口招商港務股份有限公司、蛇口集裝箱碼頭有限公司、深圳招商石化有限公司、深圳聯達拖輪有限公司、友聯船長有限公司等。

泊位：現有500噸以上泊位43個，其中萬噸級以上深水泊位13個，生產性泊位35個，非生產性泊位5個，修船泊位3個，最大靠泊能力為7.5萬噸級，貨物綜合吞吐能力1316.5萬噸，其中集裝箱吞吐能力65萬標準箱。碼頭岸線長5405米。已開通的水上客運航線有：深圳(蛇口)-香港、澳門、珠海、海口等。
倉庫堆場：生產倉庫面積為4.4萬平方米，堆場面積15.8萬平方米，集裝箱堆場12.85萬平方米，可堆存集裝箱9200個。

裝卸機械：各類主要裝卸機械為211臺，其中起重機類41臺，最大起重能力45噸;裝卸搬運機械101臺，運輸傳送機械51臺，專用機械18臺。

港作船舶：港作船4艘，總功率7644千瓦，其中拖輪2艘，最大功率2572.5千瓦。

赤灣港區：

赤灣港區是條件優越的石油服務基地和重要的深水港。港區面積2.2平方公里，西半部是商業碼頭區，東半部為石油后勤供應基地。港池面積56萬平方米。該港區主要有赤灣港航股份有限公司、凱豐碼頭有限公司、赤灣集裝箱公司、深圳赤灣石油基地股份有限公司、赤灣殼牌石油貿易聯營有限公司、華英石油聯營有限公司、深圳赤灣輪船運輸公司、主要經營集裝箱、散雜貨、油氣品等。

泊位：碼頭泊位21個，其中萬噸級以上深水泊位8個，最大靠泊能力6.5萬噸級，其中石油基地三用泊位7個，商用泊位12個，工作船泊位2個，貨物綜合吞吐能力1091.9萬噸，其中集裝箱吞吐能力55萬標準箱，碼頭岸線長3039.5米。

倉庫堆場：現有生產倉庫面積10.9萬平方米，堆場面積25.3萬平方米。

裝卸機場：各類主要裝卸機械240臺，其中起重機械27臺，最大起重能力為50噸，裝卸搬運機械93臺，傳送運輸類機構113臺，專用機械7臺。

港作船舶：港作船2艘，其中拖輪2艘，總功率為3748.5千瓦，最大功率為2352千瓦。

東角頭港區：

該港區內主要有圳華港灣企業有限公司、深圳市石油公司蛇口油庫、深圳巖谷液化石油氣公司等，主要經營散雜貨、油、氣品。

泊位：碼頭泊位5個，最大靠泊能力1000噸，貨物綜合吞吐能力40萬噸，碼頭岸線長217米。

倉庫堆場：現有生產倉庫面積4620平方米，堆場面積1.54萬平方米。

裝卸機械：各類主要機械21臺，其中起重機械5臺，最大起重能力16噸，裝卸搬運機械16臺。

媽灣港區：

該港區內主要有海星港口 發展有限、深圳樂意液體倉庫倉儲有限公司、深圳月亮灣油料港務有限公司、南油港口倉儲發展有限公司、深圳市滬星拖輪有限公司、深圳市能源港務有限公司等，其主要經營散雜貨、液體化工產品、油品和煤炭等。

媽灣港區面臨珠江礬深水航道，以漲潮流為主，含沙量少，港區天然水深9～14米。

泊位：碼頭泊位11個，其中萬噸級以上深水泊位6個，最大靠泊能力5萬噸級，貨物綜合吞吐能力1149萬噸，碼頭岸線長2543米。深圳港媽灣港區一號泊位2000年2月順利通過驗收。該泊位建設規模為3.5萬噸級，高樁梁板結構，碼頭岸線長174米，前方承臺寬18.9米。

據悉，一座占地29907平方米、倉容10萬噸的國家糧食儲備庫將在媽灣海星公司港區內興建。該項目是國家計委和國家糧食儲備局為了落實國務院關于建設中央直屬儲備糧庫倉容500億斤的決定而確定的。國家計委已將媽灣糧庫確定為第二批中央直屬儲備糧庫建設項目中唯一一個糧庫，并發出了立項批復。而媽灣港區一號泊位正是為這個糧庫而配套建設的。業內人士稱：此糧庫的年周轉量將達100萬噸，而一號泊位由此將為其業主深圳海星港口發展有限公司帶來幾百萬元的年收入。專家稱：此泊位是珠江口水域大型深水泊位之一，是一座能適應貨源變化要求的散雜貨碼頭。

倉庫堆場：生產倉庫面積7500平方米，堆場面積5萬平方米。

裝卸機械：生產用裝卸機械136臺，其中起重機械11臺，最大起重能力為60噸，裝卸搬運機械24臺，輸送機械58臺，專用機械43臺。

鹽田港區：

鹽田港區位于大鵬灣海域西北部，距大鵬灣14海里。大鵬灣口門寬10公里，水域面積為250平方公里，灣內水深達10～20米。由于大鵬半島與九龍半島的環抱，形成天然屏障，灣內水深浪水、不淤，是少有的天然良港。

2000年6月2日，歷時3年的深圳港鹽田港區二期集裝箱碼頭建設工程全面竣工，并通過了深圳市的驗收。鹽田港區二期集裝箱碼頭工程包括3個5萬噸級集裝箱專用泊位及12臺岸邊集裝箱起重機、27臺集裝箱龍門吊等相關配套設施，年設計吞吐能力為120萬標箱。二期工程總投資約39億港元。目前鹽田港區一、二期集裝箱碼頭總吞吐能力超過170萬標箱。

該港主要企業有鹽田國際集裝箱碼頭有限公司、鹽田港股份有限公司、深圳東鵬輪駁公司等，目前以經營集裝箱為主。

泊位：現有泊位12個，其中萬噸級泊位8個，貨物綜合吞吐能力1360萬噸，其中集裝箱吞吐能力170萬TEU,碼頭岸線長2600米.生產性泊位6個，非生產性泊位6個。

倉庫堆場：倉庫面積1.58萬平方米，堆場5萬平方米。

裝卸機械：各類裝卸機械46臺，其中起重機械5臺，最大起重能力20噸。

福永港區：

該港區主要企業有深圳機場港務公司、深圳空港工貿發展公司、主要經營客運、散雜貨和航空燃料等。

碼頭：現有1000噸級油料碼頭1個，通用泊位2個，客運碼頭2個，貨物綜合吞吐能力51萬噸，碼頭岸線總長370米。

已開通的水上客運航線有：深圳(黃田機場)—香港。

下洞港區及沙漁涌港區： 下洞港區為深圳東部地區油氣品專用港區，沙漁涌港區位于深圳市東部大鵬灣中部龍崗區境內，為該地區提供日雜百貨的運輸服務。以上兩港區內主要企業有深圳大鵬港灣集裝箱貨運碼頭有限公司、深圳市新鴻光碼頭有限公司、中鵬石油聯營公司大鵬灣油庫存、深圳華安液化石油氣有限公司、主要以油、氣品為主，有部分散雜貨。

泊位：現有泊位15個，最大靠泊能力為5萬噸，其中油氣泊位9個，通用泊位6個。貨物綜合吞吐能力473萬噸，碼頭岸線長2602.4米。

倉庫堆場：倉庫面積6000平方米，堆場面積1萬平方米。

裝卸機械：裝卸機械16臺，其中起重機械4臺，最大起重能力16噸，裝卸托運機械6臺，輸送機械4臺，專用機械2臺。

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